Un nuovo metodo rileva le variazioni genetiche responsabili del cancro in poche ore

Un nuovo metodo rileva le variazioni genetiche responsabili del cancro in poche ore
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Questo metodo di calcolo, un pioniere nel suo campo, è stata soprannominata SMUFIN ed è stato sviluppato dal gruppo di genomica computazionale presso il Supercomputing Center di Barcellona - National Supercomputing Center in collaborazione con altri gruppi di ricerca europei. Lo studio è stato pubblicato sulla rivista Nature Biotechnology.

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Finora, identificare le mutazioni responsabili della comparsa di tumori che colpiscono un processo lento e complesso anche difficile identificare molti tipi di mutazioni rilevanti per il tumore. Con questo nuovo sistema, gli scienziati sono in grado di rilevare in poche ore qualsiasi alterazione o modifica genetica responsabile sia per la comparsa di tumori e il loro sviluppo.

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Questo metodo comporta l'analisi del genoma completo di un tumore attraverso vari programmi per computer che vengono eseguiti uno dopo l'altro; ogni software specializzato di essere in una sorta di variazione genetica in tumore. Il suo funzionamento è molto semplice: SMUFIN confrontando direttamente il genoma delle cellule sane con il genoma di cellule tumorali dal paziente, quindi localizzare qualsiasi minima variazione in esso. Questo metodo non solo accelera il processo, ma garantisce la scoperta di alterazioni genetiche dei tumori molto aggressivi e di solito sono nascosti nell'analisi. Inoltre il suo costo è notevolmente ridotto: il sequenziamento del genoma finora ha avuto un costo di 2.000 a 3.000 Euro; questo sistema scende a 700 euro.

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Il nuovo sistema, secondo gli autori, garantisce il 90% precisione nel rilevamento quasi tutti i tipi di mutazioni genetiche. Il suo uso promuoverà una diagnosi più concreto, economico e affidabile per il paziente e la possibilità di rilevare mutazioni in centinaia di migliaia di genomi tumorali in pochi giorni.

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